El objetivo de la Jornada es doble: en primer lugar se pretende aportar un poco de luz acerca de este tema de candente actualidad, tanto desde el punto de vista de la situación y las necesidades de las empresas en esta materia, como de los últimos pasos que se están dando a nivel europeo y nacional para regular esta cuestión. En segundo lugar se prenteden identificar, en base a los conocimientos adquiridos y teniendo en cuenta los proyectos que se están desarrollando y sus resultados, identificar las necesidades de investigación para el futuro, buscando sinergias entre el mundo empresarial y la comunidad científica.
Con la organización de este tipo de jornadas, la Fundación Observatorio Español de Acuicultura, cuyo protectorado ejerce el Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino, inicia una nueva etapa, poniendose al servicio de todos los agentes del sector, con el objetivo de consolidarse como plataforma para el encuentro y el entendimiento entre los científicos y empresarios españoles. Este tipo de jornadas se enmarcan dentro de la segunda de las 4 líneas de trabajo estratégicas o prioritarias que la Fundación pretende potenciar durante el año 2009 y 2010.