Fueron las familias chinas las que hace unos 4000 mil años comenzaron a cultivar peces en estanques. El primer tratado sobre el cultivo de carpa data del 475ac, atribuido al chino fan-li, conocido como Fau Lai.
Son también numerosas las referencias realizadas por griegos y romanos. Aristóteles y Plinio escribieron sobre el cultivo de ostras en la Grecia antigua, siendo el general romano Lucinius Mureno el inventor del estanque o piscina donde se cultivaban los peces en el siglo I.
La acuicultura llega a España poco antes de 1866, año en el que se crea el Laboratorio Ictiológico de La Granja del Real Sitio de San Ildefonso, además, aparece la primera piscifactoría de trucha en el Monasterio de Piedra (Aragón) . A partir de los años 80 la acuicultura, entonces familiar y muy tradicional, puede clasificarse en tres cultivos característicos:
Mas tarde, en los años 90, con la incorporación de nuevas tecnologías y una mayor industrialización del sector, se incorporaron nuevas especies como el rodaballo en el norte de España. Esta especie plana se cultiva en tanques en tierra siendo alimentados con piensos. Otras dos especies de gran importancia son la dorada y la lubina producidas en el sur y levante de España y canarias. Estas dos especies se cultivan en jaulas flotantes en el mar alimentándose con piensos hasta que llegan a tamaño comercial, momento en el que son comercializadas.
Hoy en día la acuicultura supone, a nivel mundial, la mitad de la producción de pescado que consumimos. En España supone el 30%.