En el año 2001, la antigua Secretaria General de Pesca Marítima del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación, acomete la realización del Libro Blanco de la Acuicultura en España, una de cuyas líneas estratégicas era la creación del Observatorio Español de Acuicultura (OESA), que debía crearse con el objetivo de fomentar la interrelación entre las distintas áreas del sector de la acuicultura.
La Fundación Observatorio Español de Acuicultura nace con objetivos renovados, así, tal y como se recoge en el capítulo segundo de sus Estatutos, el fin principal de la Fundación, es de carácter de investigación en el campo de la acuicultura (cultivo de peces, moluscos, crustáceos y otras especies de interés).
El patronato de la Fundación, está integrado por las siguientes instituciones:
La Fundación Observatorio Español de Acuicultura, es una Fundación pertenciente al sector público estatal, constituida con carácter de investigación, sin finalidad lucrativa, con personalidad jurídica propia, sustantiva e independiente, siendo ejercido su protectorado por el Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino.
La Fundación con el objeto de divulgar sus actividades entre el mayor número posible de agentes del sector y en un ejercicio de trasparencia, elaborará, anualmente, un documento en el que se recojan todas los proyectos desarrollados, incluyendo los objetivos, su resultado y una pequeña valoración económica de los mismo. Este documento también incluirá las cuentas anuales de la Fundación, resumidas en los documentos de Balance y Cuenta de Resultados.
La Ley 30/2007, de 30 de octubre, de Contratos del Sector Público, otorga a la Fundación Observatorio Español de Acuicultura, como fundación del sector público estatal, la condición de poder adjudicador.